Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C5orf51A6NDU8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C5orf51A6NDU8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C5orf51A6NDU8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C5orf51A6NDU8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C5orf51A6NDU8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C5orf51A6NDU8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C5orf51A6NDU8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C5orf51A6NDU8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C5orf51A6NDU8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms