Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEIS3P1A6NDR6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEIS3P1A6NDR6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEIS3P1A6NDR6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEIS3P1A6NDR6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEIS3P1A6NDR6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MEIS3P1A6NDR6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MEIS3P1A6NDR6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MEIS3P1A6NDR6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MEIS3P1A6NDR6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MEIS3P1A6NDR6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MEIS3P1A6NDR6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MEIS3P1A6NDR6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MEIS3P1A6NDR6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MEIS3P1A6NDR6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MEIS3P1A6NDR6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MEIS3P1A6NDR6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MEIS3P1A6NDR6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MEIS3P1A6NDR6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MEIS3P1A6NDR6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
MEIS3P1A6NDR6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MEIS3P1A6NDR6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MEIS3P1A6NDR6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MEIS3P1A6NDR6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MEIS3P1A6NDR6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MEIS3P1A6NDR6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MEIS3P1A6NDR6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MEIS3P1A6NDR6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.2 ms