Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 TSKU-202ENST00000525167 542 ntTSL 416.61■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 AL512785.2-201ENST00000431696 541 ntAPPRIS P1 TSL 416.58■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PKP4-204ENST00000421462 3099 ntTSL 216.56■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SFXN5-220ENST00000490056 906 ntTSL 1 (best)16.54■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 UBE3D-204ENST00000430071 1352 ntTSL 516.49■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 DCP2-207ENST00000513585 1572 ntTSL 216.48■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SFXN5-221ENST00000495208 808 ntTSL 1 (best)16.48■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ATP23-204ENST00000551997 557 ntTSL 416.43■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 NPEPL1-206ENST00000527587 4633 ntTSL 516.42■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CAPRIN1-216ENST00000534042 574 ntTSL 516.32■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 DGKD-204ENST00000430834 5379 ntTSL 1 (best)16.31■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP83-204ENST00000546527 644 ntTSL 216.3■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SPRED2-207ENST00000452315 1365 ntTSL 1 (best)16.29■□□□□ 0.23e-9■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 EXOC6B-203ENST00000410112 1372 ntTSL 516.26■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SLX4-202ENST00000466154 3228 ntTSL 1 (best)16.15■□□□□ 0.181e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 RANBP1-205ENST00000418705 932 ntTSL 316.14■□□□□ 0.171e-10■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 RAB11FIP3-209ENST00000483002 585 ntTSL 416.03■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 UBE3D-201ENST00000237186 1879 ntTSL 1 (best)16.01■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MED4-203ENST00000417167 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.98■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)15.85■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 UBE2I-210ENST00000562482 735 ntTSL 215.83■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 NPEPL1-209ENST00000533788 899 ntTSL 515.77■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 VWCE-206ENST00000538438 1076 ntTSL 315.71■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TXNRD2-215ENST00000494454 2004 ntTSL 1 (best)15.7■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PKP4-205ENST00000426248 4134 ntTSL 1 (best)15.68■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP63-205ENST00000504013 554 ntTSL 415.63■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.092e-9■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TSKU-204ENST00000533752 643 ntTSL 415.59■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 OTUD7A-204ENST00000560598 724 ntTSL 515.58■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP63-213ENST00000514412 235 ntTSL 515.37■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.041e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PELP1-214ENST00000575329 3280 ntTSL 215.3■□□□□ 0.041e-7■■■■■ 35.3
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TBRG4Q969Z0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CALD1-208ENST00000435928 458 ntTSL 515.19■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CALD1-212ENST00000454108 558 ntTSL 515.19■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 COG3-207ENST00000618913 530 nt15.15■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TMEM39A-203ENST00000461654 588 ntTSL 415.14■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 NISCH-205ENST00000467594 1014 ntTSL 215.06■□□□□ 01e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 VARS2-203ENST00000428017 1103 ntTSL 215.05■□□□□ -01e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 LRSAM1-205ENST00000472068 850 ntTSL 515.03■□□□□ -01e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -03e-6■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 NDST1-203ENST00000518346 496 ntTSL 314.93□□□□□ -0.025e-6■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CLSTN3-213ENST00000541953 570 ntTSL 514.87□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 OTUD7A-203ENST00000560536 3431 ntTSL 214.81□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TCF19-203ENST00000496421 880 ntTSL 314.72□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CLSTN3-216ENST00000545663 533 ntTSL 414.69□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MED16-205ENST00000586017 1403 ntTSL 1 (best)14.63□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.071e-10■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TMEM39A-205ENST00000468676 935 ntTSL 314.58□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SERF2-208ENST00000409617 700 ntTSL 214.56□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 RANBP1-203ENST00000411892 584 ntTSL 214.54□□□□□ -0.081e-10■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 LRSAM1-206ENST00000483302 1994 ntTSL 214.47□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SFXN5-203ENST00000411783 915 ntTSL 314.45□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 VWCE-201ENST00000301770 3368 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 214.3□□□□□ -0.121e-10■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SDCCAG3-209ENST00000468963 686 ntTSL 214.3□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MXD4-203ENST00000513372 4228 ntTSL 214.28□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.125e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CALD1-207ENST00000430085 1938 ntTSL 214.27□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 DDX27-204ENST00000484427 4929 ntTSL 1 (best)14.25□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.136e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.141e-10■■■■■ 35.3
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