RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.1■■■■□ 3.69
NISCH-205ENST00000467594 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.05■■■■□ 3.04
NISCH-205ENST00000467594 ABCC9O60706 1549 aa33.66■■■□□ 2.98
NISCH-205ENST00000467594 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.26■■■□□ 2.75
NISCH-205ENST00000467594 NACADO15069 1562 aa32.14■■■□□ 2.74
NISCH-205ENST00000467594 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.01■■■□□ 2.71
NISCH-205ENST00000467594 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.84■■■□□ 2.69
NISCH-205ENST00000467594 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
NISCH-205ENST00000467594 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.54■■■□□ 2.64
NISCH-205ENST00000467594 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.44■■■□□ 2.62
NISCH-205ENST00000467594 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.4■■■□□ 2.62
NISCH-205ENST00000467594 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.25■■■□□ 2.59
NISCH-205ENST00000467594 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.24■■■□□ 2.59
NISCH-205ENST00000467594 SCRIBQ14160 1630 aa30.99■■■□□ 2.55
NISCH-205ENST00000467594 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.97■■■□□ 2.55
NISCH-205ENST00000467594 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
NISCH-205ENST00000467594 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.44■■■□□ 2.46
NISCH-205ENST00000467594 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.32■■■□□ 2.44
NISCH-205ENST00000467594 NCAPD3P42695 1498 aa29.66■■■□□ 2.34
NISCH-205ENST00000467594 SMARCA4P51532 1647 aa29.63■■■□□ 2.33
NISCH-205ENST00000467594 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.59■■■□□ 2.33
NISCH-205ENST00000467594 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
NISCH-205ENST00000467594 SMARCA2P51531 1590 aa29.56■■■□□ 2.32
NISCH-205ENST00000467594 HMGXB3Q12766 1538 aa29.45■■■□□ 2.31
NISCH-205ENST00000467594 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.37■■■□□ 2.29
NISCH-205ENST00000467594 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
NISCH-205ENST00000467594 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.33■■■□□ 2.29
NISCH-205ENST00000467594 ERCC6Q03468 1493 aa29.09■■■□□ 2.25
NISCH-205ENST00000467594 NESP48681 1621 aa29■■■□□ 2.23
NISCH-205ENST00000467594 WIZO95785 1651 aa28.99■■■□□ 2.23
NISCH-205ENST00000467594 CUX2O14529 1486 aa28.94■■■□□ 2.22
NISCH-205ENST00000467594 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.93■■■□□ 2.22
NISCH-205ENST00000467594 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
NISCH-205ENST00000467594 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.77■■■□□ 2.2
NISCH-205ENST00000467594 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.77■■■□□ 2.2
NISCH-205ENST00000467594 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
NISCH-205ENST00000467594 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
NISCH-205ENST00000467594 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.64■■■□□ 2.17
NISCH-205ENST00000467594 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.52■■■□□ 2.16
NISCH-205ENST00000467594 CFTRP13569 1480 aa28.51■■■□□ 2.15
NISCH-205ENST00000467594 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.46■■■□□ 2.15
NISCH-205ENST00000467594 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.43■■■□□ 2.14
NISCH-205ENST00000467594 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.42■■■□□ 2.14
NISCH-205ENST00000467594 WDR62O43379 1518 aa28.38■■■□□ 2.13
NISCH-205ENST00000467594 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.34■■■□□ 2.13
NISCH-205ENST00000467594 PRDM2Q13029 1718 aa28.22■■■□□ 2.11
NISCH-205ENST00000467594 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
NISCH-205ENST00000467594 ABCC8Q09428 1581 aa27.96■■■□□ 2.07
NISCH-205ENST00000467594 TOPBP1Q92547 1522 aa27.92■■■□□ 2.06
NISCH-205ENST00000467594 IFT140Q96RY7 1462 aa27.86■■■□□ 2.05
NISCH-205ENST00000467594 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
NISCH-205ENST00000467594 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.85■■■□□ 2.05
NISCH-205ENST00000467594 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
NISCH-205ENST00000467594 OSCARQ8IYS5 282 aa27.69■■■□□ 2.02
NISCH-205ENST00000467594 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
NISCH-205ENST00000467594 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
NISCH-205ENST00000467594 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
NISCH-205ENST00000467594 SOGA1O94964 1423 aa27.56■■■□□ 2
NISCH-205ENST00000467594 CUX1P39880 1505 aa27.54■■■□□ 2
NISCH-205ENST00000467594 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.53■■■□□ 24e-9■■■■■ 42.3
NISCH-205ENST00000467594 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.52■■■□□ 2
NISCH-205ENST00000467594 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.51■■■□□ 2
NISCH-205ENST00000467594 WDR97A6NE52 1622 aa27.45■■□□□ 1.98
NISCH-205ENST00000467594 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
NISCH-205ENST00000467594 TRIM41Q8WV44 630 aa27.37■■□□□ 1.97
NISCH-205ENST00000467594 FBLN2P98095 1184 aa27.31■■□□□ 1.96
NISCH-205ENST00000467594 CHD1O14646 1710 aa27.3■■□□□ 1.96
NISCH-205ENST00000467594 GRIN2BQ13224 1484 aa27.28■■□□□ 1.96
NISCH-205ENST00000467594 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.26■■□□□ 1.95
NISCH-205ENST00000467594 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.26■■□□□ 1.95
NISCH-205ENST00000467594 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
NISCH-205ENST00000467594 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.25■■□□□ 1.95
NISCH-205ENST00000467594 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.23■■□□□ 1.95
NISCH-205ENST00000467594 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.22■■□□□ 1.95
NISCH-205ENST00000467594 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.22■■□□□ 1.95
NISCH-205ENST00000467594 TOP2BQ02880 1626 aa27.22■■□□□ 1.95
NISCH-205ENST00000467594 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.22■■□□□ 1.95
NISCH-205ENST00000467594 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.21■■□□□ 1.95
NISCH-205ENST00000467594 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
NISCH-205ENST00000467594 ARHGEF11O15085 1522 aa27.19■■□□□ 1.94
NISCH-205ENST00000467594 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.16■■□□□ 1.94
NISCH-205ENST00000467594 SYNJ1O43426 1573 aa27.15■■□□□ 1.94
NISCH-205ENST00000467594 SYNJ2O15056 1496 aa27.15■■□□□ 1.94
NISCH-205ENST00000467594 PBRM1Q86U86 1689 aa27.14■■□□□ 1.94
NISCH-205ENST00000467594 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.04■■□□□ 1.92
NISCH-205ENST00000467594 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.98■■□□□ 1.91
NISCH-205ENST00000467594 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.94■■□□□ 1.9
NISCH-205ENST00000467594 ARAP1Q96P48 1450 aa26.93■■□□□ 1.9
NISCH-205ENST00000467594 ADAMTS12P58397 1594 aa26.92■■□□□ 1.9
NISCH-205ENST00000467594 GRIN2AQ12879 1464 aa26.92■■□□□ 1.9
NISCH-205ENST00000467594 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.9■■□□□ 1.9
NISCH-205ENST00000467594 NUP160Q12769 1436 aa26.82■■□□□ 1.88
NISCH-205ENST00000467594 CEP170Q5SW79 1584 aa26.77■■□□□ 1.88
NISCH-205ENST00000467594 KIF27Q86VH2 1401 aa26.73■■□□□ 1.87
NISCH-205ENST00000467594 IGF1RP08069 1367 aa26.66■■□□□ 1.86
NISCH-205ENST00000467594 SHROOM2Q13796 1616 aa26.65■■□□□ 1.86
NISCH-205ENST00000467594 CUL7Q14999 1698 aa26.6■■□□□ 1.85
NISCH-205ENST00000467594 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.58■■□□□ 1.85
NISCH-205ENST00000467594 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
NISCH-205ENST00000467594 JPH4Q96JJ6 628 aa26.57■■□□□ 1.84
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