Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 DFFB-211ENST00000491998 3152 ntTSL 1 (best)11.78□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 CEP152-205ENST00000558591 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 411.73□□□□□ -0.535e-8■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RPS6KA5-202ENST00000536315 2993 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 HIPK2-203ENST00000428878 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 NEPRO-222ENST00000494891 547 ntTSL 411.28□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 DLEU2-206ENST00000449579 791 ntTSL 211.26□□□□□ -0.611e-12■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 ADD1-212ENST00000508277 491 ntTSL 511.12□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 NAGK-218ENST00000489309 4388 ntTSL 211.04□□□□□ -0.644e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 DYNLT1-203ENST00000367089 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RRP12-211ENST00000536831 4476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RFX2-201ENST00000303657 3993 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SFXN2-201ENST00000369893 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 HDAC3-214ENST00000495485 797 ntTSL 310.72□□□□□ -0.695e-8■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 ZMYM4-202ENST00000441447 466 ntTSL 510.71□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MRPL55-204ENST00000348259 661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 TUBD1-215ENST00000593110 551 ntTSL 310.55□□□□□ -0.724e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 NAGK-209ENST00000464638 729 ntTSL 310.52□□□□□ -0.734e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RAPGEF5-206ENST00000458533 869 ntTSL 510.42□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 ADD1-214ENST00000509039 1569 ntTSL 210.38□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RRP12-202ENST00000370992 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SNUPN-209ENST00000568078 920 ntTSL 210.27□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MRPL55-216ENST00000366744 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 HDAC3-215ENST00000519474 736 ntTSL 310.2□□□□□ -0.785e-8■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RRP12-201ENST00000315563 4038 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.82e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RAPGEF5-212ENST00000620335 5506 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RRP12-203ENST00000414986 4242 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.852e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 NEPRO-223ENST00000496206 751 ntTSL 59.66□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 CDC73-203ENST00000482484 764 ntTSL 59.44□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 EIF4B-213ENST00000552490 841 ntTSL 29.29□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 EIF4B-212ENST00000551527 769 ntTSL 49.2□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RAPGEF5-205ENST00000451559 836 ntTSL 59.17□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 EIF4B-209ENST00000550390 871 ntTSL 59.14□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SYTL4-202ENST00000276141 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.951e-12■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 DYNLT1-202ENST00000367088 2891 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 EIF4B-204ENST00000549077 885 ntTSL 58.82□□□□□ -12e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 EIF4B-207ENST00000549645 590 ntTSL 48.82□□□□□ -12e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 CEP152-207ENST00000559444 594 ntTSL 28.82□□□□□ -15e-8■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SYTL4-204ENST00000372989 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.021e-12■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MACF1-206ENST00000422234 477 ntTSL 58.21□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 TUBD1-206ENST00000539018 1027 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.114e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.152e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SLC25A12-201ENST00000263812 2429 ntTSL 27.71□□□□□ -1.184e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SNX19-204ENST00000526579 907 ntTSL 37.68□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.194e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 LETMD1-236ENST00000553043 727 ntTSL 27.52□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 LETMD1-204ENST00000546814 894 ntTSL 27.5□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.284e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 NEPRO-210ENST00000472166 459 ntTSL 46.35□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.42e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 LETMD1-233ENST00000552433 727 ntTSL 25.92□□□□□ -1.462e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.482e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 FGF13-207ENST00000455663 687 ntTSL 35.67□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 PAFAH1B1-206ENST00000572915 1361 ntTSL 1 (best)5.44□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 VMP1-215ENST00000592619 838 ntTSL 55.44□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MACF1-210ENST00000462496 526 ntTSL 35.24□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 QRICH1-203ENST00000411682 359 ntTSL 55.21□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 129.2
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SF3B1O75533 EIF4B-211ENST00000551002 537 ntTSL 44.97□□□□□ -1.612e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.642e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 TUBD1-208ENST00000588009 812 ntTSL 34.65□□□□□ -1.674e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 ADD1-220ENST00000534870 795 ntTSL 24.51□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 BLOC1S5-204ENST00000486432 423 ntTSL 54.34□□□□□ -1.712e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 ACAP2-202ENST00000423531 475 ntTSL 54.23□□□□□ -1.732e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 QRICH1-207ENST00000450685 426 ntTSL 24.04□□□□□ -1.762e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.84e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.864e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 DCUN1D5-211ENST00000583974 290 ntTSL 52.81□□□□□ -1.962e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 ATG4C-204ENST00000414558 464 ntTSL 52.46□□□□□ -2.022e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 ARHGAP21-219ENST00000636842 551 ntTSL 52.44□□□□□ -2.022e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RABEP1-203ENST00000570487 461 ntTSL 20.88□□□□□ -2.272e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SIRT2-213ENST00000462654 2539 ntTSL 1 (best)16.98■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SIRT2-215ENST00000479290 4734 ntTSL 215.95■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SLC26A6-215ENST00000466257 706 ntTSL 39.43□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SPIDR-214ENST00000521550 1849 ntTSL 214.53□□□□□ -0.082e-8■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SPIDR-225ENST00000524141 2761 ntTSL 210.62□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 TLE3-210ENST00000557984 478 ntTSL 230.75■■■□□ 2.512e-6■■■■■ 129.1
SF3B1O75533 C1orf61-220ENST00000489918 427 ntTSL 321.47■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 129.1
SF3B1O75533 C1orf61-210ENST00000465270 543 ntTSL 221.28■■□□□ 12e-6■■■■■ 129.1
SF3B1O75533 C1orf61-223ENST00000497822 542 ntTSL 221.23■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 129.1
SF3B1O75533 C1orf61-203ENST00000368242 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.57■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 129.1
SF3B1O75533 C1orf61-219ENST00000489877 536 ntTSL 519.15■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 129.1
SF3B1O75533 C1orf61-216ENST00000484428 578 ntTSL 319.15■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 129.1
SF3B1O75533 C1orf61-215ENST00000482932 826 ntTSL 518.58■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 129.1
SF3B1O75533 C1orf61-217ENST00000486517 726 ntTSL 317.25■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 129.1
SF3B1O75533 C1orf61-213ENST00000471156 764 ntTSL 514.15□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 129.1
SF3B1O75533 TLE3-224ENST00000560996 495 ntTSL 512.63□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 129.1
SF3B1O75533 C1orf61-204ENST00000368243 879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 129.1
SF3B1O75533 WDR11-216ENST00000605543 3010 ntTSL 210.58□□□□□ -0.724e-6■■■■■ 129.1
SF3B1O75533 FBXW7-212ENST00000604872 970 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 129.1
SF3B1O75533 C1orf61-201ENST00000310027 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.29□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 129.1
SF3B1O75533 WDR11-201ENST00000263461 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.934e-6■■■■■ 129.1
SF3B1O75533 C1orf61-202ENST00000357975 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 38.39□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 129.1
SF3B1O75533 WDR11-205ENST00000497136 4954 ntTSL 1 (best)7.55□□□□□ -1.24e-6■■■■■ 129.1
SF3B1O75533 C1orf61-221ENST00000492750 475 ntTSL 57.06□□□□□ -1.282e-6■■■■■ 129.1
SF3B1O75533 C1orf61-224ENST00000497824 725 ntTSL 1 (best)4.52□□□□□ -1.692e-6■■■■■ 129.1
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