RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465270.5

C1orf61-210, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 2

Gene C1orf61, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-210ENST00000465270 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.02■■■■■ 5.28
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C1orf61-210ENST00000465270 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.25■■■■■ 4.03
C1orf61-210ENST00000465270 NACADO15069 1562 aa40.24■■■■■ 4.03
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C1orf61-210ENST00000465270 SCRIBQ14160 1630 aa39.02■■■■□ 3.84
C1orf61-210ENST00000465270 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.6■■■■□ 3.77
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C1orf61-210ENST00000465270 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.12■■■■□ 3.69
C1orf61-210ENST00000465270 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.86■■■■□ 3.65
C1orf61-210ENST00000465270 SMARCA4P51532 1647 aa37.3■■■■□ 3.56
C1orf61-210ENST00000465270 NCAPD3P42695 1498 aa37.19■■■■□ 3.54
C1orf61-210ENST00000465270 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.19■■■■□ 3.54
C1orf61-210ENST00000465270 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
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C1orf61-210ENST00000465270 SMARCA2P51531 1590 aa37.03■■■■□ 3.52
C1orf61-210ENST00000465270 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.92■■■■□ 3.5
C1orf61-210ENST00000465270 HMGXB3Q12766 1538 aa36.92■■■■□ 3.5
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C1orf61-210ENST00000465270 NESP48681 1621 aa36.45■■■■□ 3.43
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C1orf61-210ENST00000465270 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.2■■■■□ 3.39
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C1orf61-210ENST00000465270 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.98■■■■□ 3.35
C1orf61-210ENST00000465270 CUX2O14529 1486 aa35.97■■■■□ 3.35
C1orf61-210ENST00000465270 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.93■■■■□ 3.34
C1orf61-210ENST00000465270 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
C1orf61-210ENST00000465270 CFTRP13569 1480 aa35.81■■■■□ 3.32
C1orf61-210ENST00000465270 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.8■■■■□ 3.32
C1orf61-210ENST00000465270 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.66■■■■□ 3.3
C1orf61-210ENST00000465270 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.6■■■■□ 3.29
C1orf61-210ENST00000465270 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.6■■■■□ 3.29
C1orf61-210ENST00000465270 WDR62O43379 1518 aa35.52■■■■□ 3.28
C1orf61-210ENST00000465270 PRDM2Q13029 1718 aa35.5■■■■□ 3.27
C1orf61-210ENST00000465270 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
C1orf61-210ENST00000465270 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
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C1orf61-210ENST00000465270 TOPBP1Q92547 1522 aa35.08■■■■□ 3.21
C1orf61-210ENST00000465270 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.97■■■■□ 3.19
C1orf61-210ENST00000465270 ABCC8Q09428 1581 aa34.96■■■■□ 3.19
C1orf61-210ENST00000465270 IFT140Q96RY7 1462 aa34.85■■■■□ 3.17
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C1orf61-210ENST00000465270 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.67■■■■□ 3.14
C1orf61-210ENST00000465270 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.64■■■■□ 3.14
C1orf61-210ENST00000465270 SOGA1O94964 1423 aa34.62■■■■□ 3.13
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C1orf61-210ENST00000465270 OSCARQ8IYS5 282 aa34.49■■■■□ 3.11
C1orf61-210ENST00000465270 WDR97A6NE52 1622 aa34.38■■■■□ 3.09
C1orf61-210ENST00000465270 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.36■■■■□ 3.09
C1orf61-210ENST00000465270 SYNJ1O43426 1573 aa34.36■■■■□ 3.09
C1orf61-210ENST00000465270 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.34■■■■□ 3.09
C1orf61-210ENST00000465270 TOP2BQ02880 1626 aa34.33■■■■□ 3.09
C1orf61-210ENST00000465270 CHD1O14646 1710 aa34.27■■■■□ 3.08
C1orf61-210ENST00000465270 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.27■■■■□ 3.08
C1orf61-210ENST00000465270 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.21■■■■□ 3.07
C1orf61-210ENST00000465270 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.2■■■■□ 3.06
C1orf61-210ENST00000465270 GRIN2BQ13224 1484 aa34.19■■■■□ 3.06
C1orf61-210ENST00000465270 FBLN2P98095 1184 aa34.18■■■■□ 3.06
C1orf61-210ENST00000465270 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.17■■■■□ 3.06
C1orf61-210ENST00000465270 PBRM1Q86U86 1689 aa34.15■■■■□ 3.06
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C1orf61-210ENST00000465270 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
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C1orf61-210ENST00000465270 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34■■■■□ 3.03
C1orf61-210ENST00000465270 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34■■■■□ 3.03
C1orf61-210ENST00000465270 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34■■■■□ 3.03
C1orf61-210ENST00000465270 SYNJ2O15056 1496 aa34■■■■□ 3.03
C1orf61-210ENST00000465270 ARHGEF11O15085 1522 aa33.94■■■■□ 3.02
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C1orf61-210ENST00000465270 ADAMTS12P58397 1594 aa33.83■■■■□ 3.01
C1orf61-210ENST00000465270 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.83■■■■□ 3.01
C1orf61-210ENST00000465270 GRIN2AQ12879 1464 aa33.77■■■■□ 3
C1orf61-210ENST00000465270 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.76■■■□□ 2.99
C1orf61-210ENST00000465270 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.69■■■□□ 2.98
C1orf61-210ENST00000465270 ARAP1Q96P48 1450 aa33.67■■■□□ 2.98
C1orf61-210ENST00000465270 CEP170Q5SW79 1584 aa33.67■■■□□ 2.98
C1orf61-210ENST00000465270 NUP160Q12769 1436 aa33.65■■■□□ 2.98
C1orf61-210ENST00000465270 IGF1RP08069 1367 aa33.65■■■□□ 2.98
C1orf61-210ENST00000465270 KIF27Q86VH2 1401 aa33.63■■■□□ 2.97
C1orf61-210ENST00000465270 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.49■■■□□ 2.95
C1orf61-210ENST00000465270 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.44■■■□□ 2.94
C1orf61-210ENST00000465270 SHROOM2Q13796 1616 aa33.44■■■□□ 2.94
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C1orf61-210ENST00000465270 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.39■■■□□ 2.94
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