RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486517.5

C1orf61-217, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf61, Length 726 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-217ENST00000486517 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.06■■■■□ 3.84
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C1orf61-217ENST00000486517 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.11■■■■□ 3.05
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C1orf61-217ENST00000486517 SMARCA4P51532 1647 aa30.68■■■□□ 2.5
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C1orf61-217ENST00000486517 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.53■■■□□ 2.48
C1orf61-217ENST00000486517 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.51■■■□□ 2.47
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C1orf61-217ENST00000486517 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.15■■■□□ 2.42
C1orf61-217ENST00000486517 WDR62O43379 1518 aa30.12■■■□□ 2.41
C1orf61-217ENST00000486517 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.1■■■□□ 2.41
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C1orf61-217ENST00000486517 OSCARQ8IYS5 282 aa29.9■■■□□ 2.38
C1orf61-217ENST00000486517 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.87■■■□□ 2.37
C1orf61-217ENST00000486517 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.76■■■□□ 2.35
C1orf61-217ENST00000486517 WIZO95785 1651 aa29.75■■■□□ 2.35
C1orf61-217ENST00000486517 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.67■■■□□ 2.34
C1orf61-217ENST00000486517 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.67■■■□□ 2.34
C1orf61-217ENST00000486517 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.67■■■□□ 2.34
C1orf61-217ENST00000486517 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
C1orf61-217ENST00000486517 CFTRP13569 1480 aa29.57■■■□□ 2.32
C1orf61-217ENST00000486517 ARHGEF11O15085 1522 aa29.47■■■□□ 2.31
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C1orf61-217ENST00000486517 PRDM2Q13029 1718 aa29.34■■■□□ 2.29
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C1orf61-217ENST00000486517 IFT140Q96RY7 1462 aa29.29■■■□□ 2.28
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C1orf61-217ENST00000486517 CHD1O14646 1710 aa29.15■■■□□ 2.26
C1orf61-217ENST00000486517 ARAP1Q96P48 1450 aa29.12■■■□□ 2.25
C1orf61-217ENST00000486517 TOPBP1Q92547 1522 aa29.12■■■□□ 2.25
C1orf61-217ENST00000486517 ABCC8Q09428 1581 aa28.98■■■□□ 2.23
C1orf61-217ENST00000486517 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.23
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C1orf61-217ENST00000486517 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
C1orf61-217ENST00000486517 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.93■■■□□ 2.22
C1orf61-217ENST00000486517 FBLN2P98095 1184 aa28.92■■■□□ 2.22
C1orf61-217ENST00000486517 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
C1orf61-217ENST00000486517 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.74■■■□□ 2.19
C1orf61-217ENST00000486517 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.67■■■□□ 2.18
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C1orf61-217ENST00000486517 SYNJ1O43426 1573 aa28.65■■■□□ 2.18
C1orf61-217ENST00000486517 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
C1orf61-217ENST00000486517 SOGA1O94964 1423 aa28.6■■■□□ 2.17
C1orf61-217ENST00000486517 WDR97A6NE52 1622 aa28.58■■■□□ 2.17
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C1orf61-217ENST00000486517 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
C1orf61-217ENST00000486517 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
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C1orf61-217ENST00000486517 SYNJ2O15056 1496 aa28.46■■■□□ 2.15
C1orf61-217ENST00000486517 GRIN2BQ13224 1484 aa28.46■■■□□ 2.15
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C1orf61-217ENST00000486517 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.17■■■□□ 2.1
C1orf61-217ENST00000486517 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.15■■■□□ 2.1
C1orf61-217ENST00000486517 CEP170Q5SW79 1584 aa28.11■■■□□ 2.09
C1orf61-217ENST00000486517 GRIN2AQ12879 1464 aa28.09■■■□□ 2.09
C1orf61-217ENST00000486517 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.09■■■□□ 2.09
C1orf61-217ENST00000486517 SHROOM2Q13796 1616 aa28.03■■■□□ 2.08
C1orf61-217ENST00000486517 NUP160Q12769 1436 aa28.01■■■□□ 2.08
C1orf61-217ENST00000486517 ADAMTS12P58397 1594 aa28.01■■■□□ 2.07
C1orf61-217ENST00000486517 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.84■■■□□ 2.05
C1orf61-217ENST00000486517 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
C1orf61-217ENST00000486517 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.82■■■□□ 2.04
C1orf61-217ENST00000486517 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.81■■■□□ 2.04
C1orf61-217ENST00000486517 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.81■■■□□ 2.04
C1orf61-217ENST00000486517 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.76■■■□□ 2.03
C1orf61-217ENST00000486517 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
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