RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497822.5

C1orf61-223, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 2

Gene C1orf61, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-223ENST00000497822 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.15■■■■■ 5.3
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C1orf61-223ENST00000497822 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.02■■■■■ 4.48
C1orf61-223ENST00000497822 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.95■■■■■ 4.15
C1orf61-223ENST00000497822 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.76■■■■■ 4.12
C1orf61-223ENST00000497822 NACADO15069 1562 aa40.69■■■■■ 4.1
C1orf61-223ENST00000497822 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.47■■■■■ 4.07
C1orf61-223ENST00000497822 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.26■■■■■ 4.04
C1orf61-223ENST00000497822 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.11■■■■■ 4.01
C1orf61-223ENST00000497822 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.07■■■■■ 4
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C1orf61-223ENST00000497822 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.68■■■■□ 3.94
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C1orf61-223ENST00000497822 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.11■■■■□ 3.85
C1orf61-223ENST00000497822 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.89■■■■□ 3.82
C1orf61-223ENST00000497822 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.82■■■■□ 3.8
C1orf61-223ENST00000497822 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.78■■■■□ 3.8
C1orf61-223ENST00000497822 NCAPD3P42695 1498 aa37.62■■■■□ 3.61
C1orf61-223ENST00000497822 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.56■■■■□ 3.6
C1orf61-223ENST00000497822 SMARCA4P51532 1647 aa37.51■■■■□ 3.6
C1orf61-223ENST00000497822 SMARCA2P51531 1590 aa37.37■■■■□ 3.57
C1orf61-223ENST00000497822 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
C1orf61-223ENST00000497822 HMGXB3Q12766 1538 aa37.29■■■■□ 3.56
C1orf61-223ENST00000497822 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
C1orf61-223ENST00000497822 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.17■■■■□ 3.54
C1orf61-223ENST00000497822 ERCC6Q03468 1493 aa37.13■■■■□ 3.54
C1orf61-223ENST00000497822 NESP48681 1621 aa37.1■■■■□ 3.53
C1orf61-223ENST00000497822 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.09■■■■□ 3.53
C1orf61-223ENST00000497822 CUX2O14529 1486 aa36.95■■■■□ 3.51
C1orf61-223ENST00000497822 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.94■■■■□ 3.5
C1orf61-223ENST00000497822 WIZO95785 1651 aa36.71■■■■□ 3.47
C1orf61-223ENST00000497822 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.69■■■■□ 3.46
C1orf61-223ENST00000497822 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.45
C1orf61-223ENST00000497822 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.53■■■■□ 3.44
C1orf61-223ENST00000497822 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.52■■■■□ 3.44
C1orf61-223ENST00000497822 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.51■■■■□ 3.44
C1orf61-223ENST00000497822 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
C1orf61-223ENST00000497822 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.21■■■■□ 3.39
C1orf61-223ENST00000497822 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
C1orf61-223ENST00000497822 CFTRP13569 1480 aa36.1■■■■□ 3.37
C1orf61-223ENST00000497822 WDR62O43379 1518 aa36.09■■■■□ 3.37
C1orf61-223ENST00000497822 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.09■■■■□ 3.37
C1orf61-223ENST00000497822 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.08■■■■□ 3.37
C1orf61-223ENST00000497822 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.86■■■■□ 3.33
C1orf61-223ENST00000497822 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
C1orf61-223ENST00000497822 PRDM2Q13029 1718 aa35.63■■■■□ 3.29
C1orf61-223ENST00000497822 TRIM41Q8WV44 630 aa35.45■■■■□ 3.27
C1orf61-223ENST00000497822 TOPBP1Q92547 1522 aa35.42■■■■□ 3.26
C1orf61-223ENST00000497822 OSCARQ8IYS5 282 aa35.4■■■■□ 3.26
C1orf61-223ENST00000497822 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
C1orf61-223ENST00000497822 IFT140Q96RY7 1462 aa35.35■■■■□ 3.25
C1orf61-223ENST00000497822 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.25■■■■□ 3.23
C1orf61-223ENST00000497822 ABCC8Q09428 1581 aa35.25■■■■□ 3.23
C1orf61-223ENST00000497822 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
C1orf61-223ENST00000497822 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.1■■■■□ 3.21
C1orf61-223ENST00000497822 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
C1orf61-223ENST00000497822 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
C1orf61-223ENST00000497822 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
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C1orf61-223ENST00000497822 SOGA1O94964 1423 aa34.94■■■■□ 3.18
C1orf61-223ENST00000497822 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
C1orf61-223ENST00000497822 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.9■■■■□ 3.18
C1orf61-223ENST00000497822 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.9■■■■□ 3.18
C1orf61-223ENST00000497822 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.9■■■■□ 3.18
C1orf61-223ENST00000497822 CUX1P39880 1505 aa34.9■■■■□ 3.18
C1orf61-223ENST00000497822 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.89■■■■□ 3.18
C1orf61-223ENST00000497822 FBLN2P98095 1184 aa34.87■■■■□ 3.17
C1orf61-223ENST00000497822 CHD1O14646 1710 aa34.84■■■■□ 3.17
C1orf61-223ENST00000497822 ARHGEF11O15085 1522 aa34.81■■■■□ 3.16
C1orf61-223ENST00000497822 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.69■■■■□ 3.14
C1orf61-223ENST00000497822 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.64■■■■□ 3.14
C1orf61-223ENST00000497822 WDR97A6NE52 1622 aa34.58■■■■□ 3.13
C1orf61-223ENST00000497822 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
C1orf61-223ENST00000497822 GRIN2BQ13224 1484 aa34.57■■■■□ 3.12
C1orf61-223ENST00000497822 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
C1orf61-223ENST00000497822 ARAP1Q96P48 1450 aa34.5■■■■□ 3.11
C1orf61-223ENST00000497822 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.49■■■■□ 3.11
C1orf61-223ENST00000497822 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.45■■■■□ 3.11
C1orf61-223ENST00000497822 SYNJ2O15056 1496 aa34.43■■■■□ 3.1
C1orf61-223ENST00000497822 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.43■■■■□ 3.1
C1orf61-223ENST00000497822 PBRM1Q86U86 1689 aa34.41■■■■□ 3.1
C1orf61-223ENST00000497822 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.38■■■■□ 3.09
C1orf61-223ENST00000497822 SYNJ1O43426 1573 aa34.37■■■■□ 3.09
C1orf61-223ENST00000497822 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.35■■■■□ 3.09
C1orf61-223ENST00000497822 TOP2BQ02880 1626 aa34.3■■■■□ 3.08
C1orf61-223ENST00000497822 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.28■■■■□ 3.08
C1orf61-223ENST00000497822 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
C1orf61-223ENST00000497822 GRIN2AQ12879 1464 aa34.14■■■■□ 3.06
C1orf61-223ENST00000497822 ADAMTS12P58397 1594 aa34.11■■■■□ 3.05
C1orf61-223ENST00000497822 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.04■■■■□ 3.04
C1orf61-223ENST00000497822 CEP170Q5SW79 1584 aa34.03■■■■□ 3.04
C1orf61-223ENST00000497822 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.02■■■■□ 3.04
C1orf61-223ENST00000497822 NUP160Q12769 1436 aa34.02■■■■□ 3.04
C1orf61-223ENST00000497822 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.99■■■■□ 3.03
C1orf61-223ENST00000497822 SHROOM2Q13796 1616 aa33.82■■■■□ 3
C1orf61-223ENST00000497822 JPH4Q96JJ6 628 aa33.74■■■□□ 2.99
C1orf61-223ENST00000497822 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
C1orf61-223ENST00000497822 IGF1RP08069 1367 aa33.72■■■□□ 2.99
C1orf61-223ENST00000497822 KIF27Q86VH2 1401 aa33.65■■■□□ 2.98
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