Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX5O60225 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX5O60225 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX5O60225 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX5O60225 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX5O60225 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX5O60225 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX5O60225 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX5O60225 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms