Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 RABGEF1-211ENST00000503687 4139 ntTSL 214.28□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 161.6
UTP3Q9NQZ2 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.28e-7■■■■■ 161.6
UTP3Q9NQZ2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.52e-8■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.115e-7■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 TBC1D9B-219ENST00000524222 927 ntTSL 511.5□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 FNDC3B-202ENST00000415807 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.872e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 SCRN3-204ENST00000427038 839 ntTSL 526.52■■□□□ 1.841e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 SSNA1-203ENST00000463511 570 ntTSL 224.45■■□□□ 1.51e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.473e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 SCRN3-209ENST00000488349 568 ntTSL 423.82■■□□□ 1.41e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.395e-9■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 SCRN3-203ENST00000424069 548 ntTSL 423.49■■□□□ 1.351e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.325e-9■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 SSNA1-202ENST00000459860 1170 ntTSL 1 (best)23.22■■□□□ 1.311e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 POLR2F-212ENST00000492213 550 ntTSL 422.7■■□□□ 1.225e-9■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.195e-9■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.091e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.091e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.041e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 SCRN3-205ENST00000435964 582 ntTSL 321.15■□□□□ 0.981e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.931e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-224ENST00000582456 545 ntTSL 420.83■□□□□ 0.931e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-208ENST00000577696 656 ntTSL 420.81■□□□□ 0.921e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.91e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL1-202ENST00000517668 665 ntTSL 520.59■□□□□ 0.894e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.861e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.751e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-228ENST00000583242 600 ntTSL 419.6■□□□□ 0.731e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-217ENST00000578941 1079 ntTSL 1 (best)19.13■□□□□ 0.651e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 AL390879.2-202ENST00000431464 646 ntTSL 219.06■□□□□ 0.641e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-226ENST00000582608 559 ntTSL 419■□□□□ 0.631e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 AP006621.5-201ENST00000623846 1139 nt18.95■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.611e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-229ENST00000583359 896 ntTSL 518.64■□□□□ 0.571e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.541e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-225ENST00000582545 470 ntTSL 418.27■□□□□ 0.521e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-207ENST00000577471 573 ntTSL 418.27■□□□□ 0.521e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.492e-8■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.471e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 CLCN7-209ENST00000565092 2740 ntTSL 217.94■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-213ENST00000578064 548 ntTSL 417.9■□□□□ 0.461e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-240ENST00000585115 609 ntTSL 417.83■□□□□ 0.441e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-222ENST00000582395 565 ntTSL 417.74■□□□□ 0.431e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-232ENST00000584024 1965 ntTSL 217.49■□□□□ 0.391e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.341e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-209ENST00000577707 534 ntTSL 417.14■□□□□ 0.331e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 POLR2F-209ENST00000483713 615 ntTSL 317■□□□□ 0.315e-9■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 LDLRAD3-205ENST00000532490 562 ntTSL 416.77■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-212ENST00000577888 617 ntTSL 216.27■□□□□ 0.21e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.21e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 IMMP1L-203ENST00000527184 486 ntTSL 316.25■□□□□ 0.193e-10■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.155e-9■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 TEX9-208ENST00000560827 689 ntTSL 315.9■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 IMMP1L-210ENST00000532624 985 ntTSL 1 (best)15.59■□□□□ 0.093e-10■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-235ENST00000584791 559 ntTSL 215.48■□□□□ 0.071e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 SMARCE1-209ENST00000478349 1090 ntTSL 515.28■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL1-204ENST00000519435 1050 ntTSL 314.98□□□□□ -0.014e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 POLR2F-210ENST00000484894 551 ntTSL 414.78□□□□□ -0.045e-9■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.061e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 CNOT1-206ENST00000564557 582 ntTSL 314.58□□□□□ -0.088e-9■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 CNOT1-215ENST00000569020 535 ntTSL 414.41□□□□□ -0.18e-9■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.123e-10■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.131e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.145e-9■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 CNOT1-213ENST00000568158 496 ntTSL 313.96□□□□□ -0.178e-9■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 CNOT1-220ENST00000569916 599 ntTSL 313.89□□□□□ -0.198e-9■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL1-207ENST00000521180 6951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.253e-10■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 IMMP1L-204ENST00000528161 1067 ntTSL 1 (best)13.43□□□□□ -0.263e-10■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 SCRN3-207ENST00000458563 804 ntTSL 313.38□□□□□ -0.271e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 SCRN3-206ENST00000437944 1141 ntTSL 213.34□□□□□ -0.271e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 ETHE1-202ENST00000594342 702 ntTSL 213.25□□□□□ -0.291e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 AP006621.5-202ENST00000623692 636 ntBASIC13.15□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.323e-10■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL1-212ENST00000522873 613 ntTSL 313□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 LDLRAD3-201ENST00000315571 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 TCF20-201ENST00000335626 6237 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.391e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 PHKG2-210ENST00000569684 1134 ntTSL 512.51□□□□□ -0.411e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.423e-10■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 IMMP1L-205ENST00000529749 475 ntTSL 312.43□□□□□ -0.423e-10■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-237ENST00000585044 4327 ntTSL 212.32□□□□□ -0.441e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 GNE-203ENST00000447283 2174 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 SCRN3-210ENST00000490927 929 ntTSL 312.07□□□□□ -0.481e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 SCRN3-212ENST00000548868 1594 ntTSL 212.05□□□□□ -0.481e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 CTSC-201ENST00000227266 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL1-201ENST00000399640 6764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.534e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-231ENST00000583778 481 ntTSL 211.39□□□□□ -0.591e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-215ENST00000578913 563 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.591e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 IMMP1L-206ENST00000530023 552 ntTSL 311.25□□□□□ -0.613e-10■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 SCRN3-202ENST00000409673 1788 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.611e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-233ENST00000584408 497 ntTSL 411.17□□□□□ -0.621e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 CTSC-204ENST00000527018 733 ntTSL 511.17□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-211ENST00000577834 540 ntTSL 411.07□□□□□ -0.641e-18■■■■■ 161.5
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