Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 PAXIP1-205ENST00000464717 3792 ntTSL 58.22□□□□□ -1.092e-8■■■□□ 15.4
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TARDBPQ13148 RBBP6-209ENST00000567686 1138 ntTSL 56.33□□□□□ -1.42e-8■■■□□ 15.4
TARDBPQ13148 RBBP6-208ENST00000564726 514 ntTSL 36.23□□□□□ -1.412e-8■■■□□ 15.4
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TARDBPQ13148 PIK3CB-207ENST00000473435 904 ntTSL 55.41□□□□□ -1.542e-8■■■□□ 15.4
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TARDBPQ13148 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.316e-8■■■□□ 15.4
TARDBPQ13148 C21orf59-208ENST00000483315 1872 ntTSL 213.31□□□□□ -0.286e-8■■■□□ 15.4
TARDBPQ13148 CIAO1-201ENST00000272402 3588 ntTSL 211.37□□□□□ -0.596e-8■■■□□ 15.4
TARDBPQ13148 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.156e-8■■■□□ 15.4
TARDBPQ13148 SSBP2-213ENST00000509743 779 ntTSL 47.32□□□□□ -1.246e-8■■■□□ 15.4
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TARDBPQ13148 PSMD3-204ENST00000540504 458 ntTSL 316.99■□□□□ 0.312e-7■■■□□ 15.4
TARDBPQ13148 PSMD3-203ENST00000485835 2888 ntTSL 210.82□□□□□ -0.682e-7■■■□□ 15.4
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TARDBPQ13148 RPL27A-203ENST00000525981 297 ntTSL 515.01□□□□□ -0.016e-12■■■□□ 15.3
TARDBPQ13148 RPL27A-212ENST00000534599 651 ntTSL 512.93□□□□□ -0.346e-12■■■□□ 15.3
TARDBPQ13148 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.536e-12■■■□□ 15.3
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TARDBPQ13148 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.246e-12■■■□□ 15.3
TARDBPQ13148 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.366e-12■■■□□ 15.3
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TARDBPQ13148 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.22e-6■■■□□ 15.3
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TARDBPQ13148 NDEL1-211ENST00000581679 582 ntTSL 43.67□□□□□ -1.825e-7■■■□□ 15.3
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TARDBPQ13148 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.952e-11■■■□□ 15.3
TARDBPQ13148 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.474e-8■■■□□ 15.3
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TARDBPQ13148 SKIV2L2-207ENST00000506750 3271 ntTSL 24.09□□□□□ -1.751e-6■■■□□ 15.2
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TARDBPQ13148 RRP36-202ENST00000607394 528 ntTSL 25.21□□□□□ -1.586e-8■■■□□ 15.2
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TARDBPQ13148 CAPRIN1-201ENST00000341394 4108 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.85e-13■■■□□ 15.2
TARDBPQ13148 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -15e-13■■■□□ 15.2
TARDBPQ13148 CAPRIN1-208ENST00000530008 580 ntTSL 47.8□□□□□ -1.165e-13■■■□□ 15.2
TARDBPQ13148 CAPRIN1-211ENST00000532755 565 ntTSL 46.25□□□□□ -1.415e-13■■■□□ 15.2
TARDBPQ13148 CAPRIN1-214ENST00000533641 429 ntTSL 43.45□□□□□ -1.865e-13■■■□□ 15.2
TARDBPQ13148 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.149e-7■■■□□ 15.2
TARDBPQ13148 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.191e-7■■■□□ 15.1
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TARDBPQ13148 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.241e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.281e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.391e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.41e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.41e-7■■■□□ 15.1
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TARDBPQ13148 RHOH-221ENST00000615577 2227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.451e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 RHOH-207ENST00000507851 814 ntTSL 310.98□□□□□ -0.651e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 RHOH-201ENST00000381799 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.791e-7■■■□□ 15.1
TARDBPQ13148 RHOH-211ENST00000513894 571 ntTSL 49.97□□□□□ -0.811e-7■■■□□ 15.1
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TARDBPQ13148 RHOH-208ENST00000508513 874 ntTSL 38.75□□□□□ -1.011e-7■■■□□ 15.1
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