Protein–RNA interactions for Protein: P41162

ETV3, ETS translocation variant 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV3P41162 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV3P41162 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV3P41162 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV3P41162 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV3P41162 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV3P41162 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV3P41162 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV3P41162 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV3P41162 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV3P41162 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV3P41162 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV3P41162 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV3P41162 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV3P41162 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV3P41162 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV3P41162 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV3P41162 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV3P41162 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV3P41162 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV3P41162 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV3P41162 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV3P41162 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV3P41162 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV3P41162 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV3P41162 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV3P41162 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV3P41162 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV3P41162 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV3P41162 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms