Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms