Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-3Q9BYR4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms