Protein–RNA interactions for Protein: O75920

SERF1A, Small EDRK-rich factor 1, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1AO75920 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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SERF1AO75920 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SERF1AO75920 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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