Protein–RNA interactions for Protein: O75920

SERF1A, Small EDRK-rich factor 1, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1AO75920 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SERF1AO75920 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SERF1AO75920 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERF1AO75920 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SERF1AO75920 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERF1AO75920 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERF1AO75920 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERF1AO75920 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERF1AO75920 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERF1AO75920 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SERF1AO75920 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SERF1AO75920 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SERF1AO75920 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SERF1AO75920 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERF1AO75920 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERF1AO75920 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERF1AO75920 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERF1AO75920 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERF1AO75920 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERF1AO75920 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERF1AO75920 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERF1AO75920 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERF1AO75920 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERF1AO75920 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERF1AO75920 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERF1AO75920 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERF1AO75920 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERF1AO75920 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERF1AO75920 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERF1AO75920 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERF1AO75920 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERF1AO75920 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERF1AO75920 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERF1AO75920 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SERF1AO75920 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERF1AO75920 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERF1AO75920 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERF1AO75920 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERF1AO75920 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERF1AO75920 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERF1AO75920 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERF1AO75920 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERF1AO75920 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERF1AO75920 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERF1AO75920 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERF1AO75920 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERF1AO75920 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERF1AO75920 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERF1AO75920 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERF1AO75920 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERF1AO75920 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERF1AO75920 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SERF1AO75920 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERF1AO75920 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERF1AO75920 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERF1AO75920 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERF1AO75920 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERF1AO75920 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERF1AO75920 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERF1AO75920 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERF1AO75920 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERF1AO75920 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERF1AO75920 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERF1AO75920 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERF1AO75920 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERF1AO75920 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERF1AO75920 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERF1AO75920 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERF1AO75920 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERF1AO75920 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERF1AO75920 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERF1AO75920 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERF1AO75920 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERF1AO75920 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERF1AO75920 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERF1AO75920 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERF1AO75920 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERF1AO75920 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERF1AO75920 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SERF1AO75920 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERF1AO75920 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERF1AO75920 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERF1AO75920 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERF1AO75920 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERF1AO75920 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERF1AO75920 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERF1AO75920 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERF1AO75920 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERF1AO75920 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERF1AO75920 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERF1AO75920 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SERF1AO75920 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERF1AO75920 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERF1AO75920 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERF1AO75920 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERF1AO75920 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERF1AO75920 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERF1AO75920 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERF1AO75920 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERF1AO75920 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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