Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AGAP9Q5VTM2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms