Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A1P52655 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms