Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB9AP51151 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB9AP51151 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9AP51151 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB9AP51151 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RAB9AP51151 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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