Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms