Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAA1O43292 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAA1O43292 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms