Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HRCT1Q6UXD1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms