Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPIAP49247 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPIAP49247 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPIAP49247 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPIAP49247 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPIAP49247 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPIAP49247 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPIAP49247 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPIAP49247 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPIAP49247 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPIAP49247 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPIAP49247 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPIAP49247 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPIAP49247 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPIAP49247 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPIAP49247 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPIAP49247 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms