Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 ACADVL-236ENST00000583850 903 ntTSL 219.39■□□□□ 0.691e-14■■□□□ 11.4
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PCBP1Q15365 ACADVL-214ENST00000578711 1732 nt17.5■□□□□ 0.391e-14■■□□□ 11.4
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PCBP1Q15365 ACADVL-215ENST00000578809 709 ntTSL 215.43■□□□□ 0.061e-14■■□□□ 11.4
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PCBP1Q15365 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.662e-13■■□□□ 11.4
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PCBP1Q15365 CYBA-207ENST00000566534 1006 ntTSL 515.65■□□□□ 0.12e-13■■□□□ 11.4
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PCBP1Q15365 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.045e-17■■□□□ 11.4
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PCBP1Q15365 PRKAB1-209ENST00000545870 566 ntTSL 38.78□□□□□ -16e-7■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 PRKAB1-208ENST00000545223 583 ntTSL 27.91□□□□□ -1.146e-7■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 RPL10-217ENST00000492572 1656 ntTSL 518.7■□□□□ 0.586e-14■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.046e-14■■□□□ 11.4
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PCBP1Q15365 RPL10-204ENST00000424325 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.456e-14■■□□□ 11.4
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PCBP1Q15365 RPL10-216ENST00000491035 1369 ntTSL 511.86□□□□□ -0.516e-14■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 RPL10-201ENST00000344746 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)10.89□□□□□ -0.676e-14■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 GNB1-207ENST00000472614 708 ntTSL 225.36■■□□□ 1.652e-6■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.042e-6■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.832e-6■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.82e-6■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CS-202ENST00000542324 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.726e-13■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CS-215ENST00000549143 2811 ntTSL 28.94□□□□□ -0.986e-13■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.146e-13■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.226e-13■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CS-213ENST00000548746 551 ntTSL 56.59□□□□□ -1.352e-6■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 FASN-205ENST00000584610 857 ntTSL 220.97■□□□□ 0.953e-13■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 FASN-202ENST00000578424 951 ntTSL 220.2■□□□□ 0.823e-13■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 GNB2-211ENST00000469287 1702 ntTSL 216.31■□□□□ 0.23e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 UBQLN2-201ENST00000338222 4230 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.893e-10■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 RPL5-201ENST00000315741 681 ntTSL 515.08■□□□□ 02e-30■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.445e-16■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.055e-16■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 GAPDH-206ENST00000466525 1720 ntTSL 515.2■□□□□ 0.025e-16■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.015e-16■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 GAPDH-208ENST00000474249 1333 ntTSL 514.81□□□□□ -0.045e-16■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.135e-16■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.255e-16■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 GAPDH-211ENST00000619601 1086 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.455e-16■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 GAPDH-207ENST00000466588 1363 ntTSL 512.05□□□□□ -0.485e-16■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.561e-6■□□□□ 11.3
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PCBP1Q15365 SLC39A4-207ENST00000531013 795 ntTSL 221.04■□□□□ 0.965e-9■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.825e-9■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 SLC39A4-206ENST00000530807 498 ntTSL 217.82■□□□□ 0.445e-9■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 SLC39A4-209ENST00000532718 668 ntTSL 1 (best)16.97■□□□□ 0.315e-9■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 SLC39A4-205ENST00000529462 2778 ntTSL 216.09■□□□□ 0.175e-9■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.075e-9■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.015e-9■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 CES2-202ENST00000417689 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.515e-9■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 CES2-201ENST00000317091 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.665e-9■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.11e-9■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 LRP5-206ENST00000529993 5103 ntTSL 1 (best)15.12■□□□□ 0.011e-9■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.282e-16■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 MCM4-208ENST00000519470 498 ntTSL 213.15□□□□□ -0.32e-16■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 MCM4-202ENST00000517709 842 ntTSL 213.09□□□□□ -0.312e-16■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 MCM4-205ENST00000518680 862 ntTSL 513.07□□□□□ -0.322e-16■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.342e-16■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 MCM4-209ENST00000520637 839 ntTSL 211.88□□□□□ -0.512e-16■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 PRRC2A-205ENST00000464079 451 ntTSL 29.33□□□□□ -0.922e-16■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 FASN-204ENST00000580382 681 ntTSL 319.13■□□□□ 0.653e-13■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 MAN2A2-221ENST00000560451 5124 ntTSL 1 (best)19.92■□□□□ 0.783e-6■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.33e-6■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 MAN2A2-202ENST00000557865 2671 ntTSL 212.79□□□□□ -0.363e-6■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 MAN2A2-204ENST00000558161 4918 ntTSL 1 (best)12.33□□□□□ -0.443e-6■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 MAN2A2-201ENST00000360468 6268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.623e-6■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.786e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.646e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.486e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.466e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 PNCK-225ENST00000473680 1232 ntTSL 224.16■■□□□ 1.466e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 PNCK-221ENST00000466074 1564 ntTSL 222.4■■□□□ 1.186e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 PNCK-208ENST00000422811 771 ntTSL 322.07■■□□□ 1.126e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.046e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 ARL6IP1-207ENST00000567969 581 ntTSL 220.98■□□□□ 0.956e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 PLOD3-214ENST00000481461 564 ntTSL 420.77■□□□□ 0.926e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 PNCK-231ENST00000488994 1437 ntTSL 220.19■□□□□ 0.826e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.746e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 PNCK-230ENST00000488168 976 ntTSL 319.28■□□□□ 0.686e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 ARL6IP1-203ENST00000562234 391 ntTSL 518.81■□□□□ 0.66e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 PNCK-224ENST00000472324 2143 ntTSL 1 (best)18.47■□□□□ 0.556e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 PLOD3-202ENST00000414785 539 ntTSL 518.46■□□□□ 0.556e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 PNCK-222ENST00000466638 1204 ntTSL 218.28■□□□□ 0.526e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.476e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 ATP5C1-210ENST00000493053 1096 ntTSL 517.84■□□□□ 0.456e-7■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.416e-7■□□□□ 11.3
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