RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548746.5

CS-213, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-213ENST00000548746 NISCHQ9Y2I1 1504 aa14.51□□□□□ -0.09
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CS-213ENST00000548746 NACADO15069 1562 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-213ENST00000548746 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
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CS-213ENST00000548746 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11.37□□□□□ -0.59
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CS-213ENST00000548746 NCAPD3P42695 1498 aa11.19□□□□□ -0.62
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CS-213ENST00000548746 FANCD2Q9BXW9 1451 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-213ENST00000548746 CEP164Q9UPV0 1460 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-213ENST00000548746 WDR62O43379 1518 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-213ENST00000548746 MRC2Q9UBG0 1479 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-213ENST00000548746 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
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CS-213ENST00000548746 SYNJ1O43426 1573 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-213ENST00000548746 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-213ENST00000548746 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
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CS-213ENST00000548746 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-213ENST00000548746 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-213ENST00000548746 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.31□□□□□ -0.76
CS-213ENST00000548746 PBRM1Q86U86 1689 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-213ENST00000548746 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-213ENST00000548746 GRIN2BQ13224 1484 aa10.29□□□□□ -0.76
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CS-213ENST00000548746 GAPVD1Q14C86 1478 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-213ENST00000548746 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-213ENST00000548746 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-213ENST00000548746 CHD1O14646 1710 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-213ENST00000548746 ERICH3Q5RHP9 1530 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-213ENST00000548746 SYNJ2O15056 1496 aa10.23□□□□□ -0.77
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CS-213ENST00000548746 ARHGEF11O15085 1522 aa10.09□□□□□ -0.79
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CS-213ENST00000548746 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-213ENST00000548746 SHROOM2Q13796 1616 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-213ENST00000548746 FBLN2P98095 1184 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-213ENST00000548746 TRIM41Q8WV44 630 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-213ENST00000548746 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa10.07□□□□□ -0.8
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