Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRQQ9UMZ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRQQ9UMZ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRQQ9UMZ3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms