Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
ZNF608Q9ULD9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC42.6■■■■■ 4.41
ZNF608Q9ULD9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
ZNF608Q9ULD9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC42.58■■■■■ 4.41
ZNF608Q9ULD9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
ZNF608Q9ULD9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
ZNF608Q9ULD9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
ZNF608Q9ULD9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
ZNF608Q9ULD9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
ZNF608Q9ULD9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
ZNF608Q9ULD9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
ZNF608Q9ULD9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
ZNF608Q9ULD9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
ZNF608Q9ULD9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
ZNF608Q9ULD9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
ZNF608Q9ULD9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
ZNF608Q9ULD9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
ZNF608Q9ULD9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC42.47■■■■■ 4.39
ZNF608Q9ULD9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
ZNF608Q9ULD9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
ZNF608Q9ULD9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ZNF608Q9ULD9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
ZNF608Q9ULD9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
ZNF608Q9ULD9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.39
ZNF608Q9ULD9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
ZNF608Q9ULD9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
ZNF608Q9ULD9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
ZNF608Q9ULD9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
ZNF608Q9ULD9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42.44■■■■■ 4.38
ZNF608Q9ULD9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
ZNF608Q9ULD9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
ZNF608Q9ULD9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
ZNF608Q9ULD9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
ZNF608Q9ULD9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
ZNF608Q9ULD9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
ZNF608Q9ULD9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
ZNF608Q9ULD9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
ZNF608Q9ULD9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
ZNF608Q9ULD9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
ZNF608Q9ULD9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
ZNF608Q9ULD9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.37
ZNF608Q9ULD9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
ZNF608Q9ULD9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
ZNF608Q9ULD9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
ZNF608Q9ULD9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
ZNF608Q9ULD9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC42.36■■■■■ 4.37
ZNF608Q9ULD9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
ZNF608Q9ULD9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
ZNF608Q9ULD9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
ZNF608Q9ULD9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
ZNF608Q9ULD9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
ZNF608Q9ULD9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
ZNF608Q9ULD9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC42.34■■■■■ 4.37
ZNF608Q9ULD9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
ZNF608Q9ULD9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
ZNF608Q9ULD9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
ZNF608Q9ULD9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
ZNF608Q9ULD9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
ZNF608Q9ULD9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
ZNF608Q9ULD9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
ZNF608Q9ULD9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
ZNF608Q9ULD9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
ZNF608Q9ULD9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
ZNF608Q9ULD9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
ZNF608Q9ULD9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
ZNF608Q9ULD9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
ZNF608Q9ULD9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
ZNF608Q9ULD9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
ZNF608Q9ULD9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
ZNF608Q9ULD9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
ZNF608Q9ULD9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
ZNF608Q9ULD9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
ZNF608Q9ULD9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
ZNF608Q9ULD9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
ZNF608Q9ULD9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
ZNF608Q9ULD9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
ZNF608Q9ULD9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
ZNF608Q9ULD9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
ZNF608Q9ULD9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms