Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UPB1Q9UBR1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPB1Q9UBR1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms