Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW6

NMRK1, Nicotinamide riboside kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK1Q9NWW6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NMRK1Q9NWW6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NMRK1Q9NWW6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NMRK1Q9NWW6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms