Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS26

SPANXA1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome A, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXA1Q9NS26 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPANXA1Q9NS26 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPANXA1Q9NS26 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPANXA1Q9NS26 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPANXA1Q9NS26 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms