Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A4GALTQ9NPC4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A4GALTQ9NPC4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A4GALTQ9NPC4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A4GALTQ9NPC4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A4GALTQ9NPC4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A4GALTQ9NPC4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A4GALTQ9NPC4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A4GALTQ9NPC4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A4GALTQ9NPC4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A4GALTQ9NPC4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A4GALTQ9NPC4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A4GALTQ9NPC4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
A4GALTQ9NPC4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A4GALTQ9NPC4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A4GALTQ9NPC4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A4GALTQ9NPC4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
A4GALTQ9NPC4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A4GALTQ9NPC4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A4GALTQ9NPC4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A4GALTQ9NPC4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A4GALTQ9NPC4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A4GALTQ9NPC4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A4GALTQ9NPC4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A4GALTQ9NPC4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms