Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MIXL1Q9H2W2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MIXL1Q9H2W2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms