Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Y0

ATG5, Autophagy protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG5Q9H1Y0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG5Q9H1Y0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG5Q9H1Y0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG5Q9H1Y0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG5Q9H1Y0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG5Q9H1Y0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG5Q9H1Y0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG5Q9H1Y0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG5Q9H1Y0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG5Q9H1Y0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms