Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PBDC1Q9BVG4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PBDC1Q9BVG4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms