Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBB2BQ9BVA1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB2BQ9BVA1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB2BQ9BVA1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBB2BQ9BVA1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.5 ms