Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC77Q9BR77 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC77Q9BR77 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC77Q9BR77 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms