Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BPIFA3Q9BQP9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BPIFA3Q9BQP9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BPIFA3Q9BQP9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BPIFA3Q9BQP9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BPIFA3Q9BQP9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BPIFA3Q9BQP9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BPIFA3Q9BQP9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BPIFA3Q9BQP9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BPIFA3Q9BQP9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BPIFA3Q9BQP9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BPIFA3Q9BQP9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BPIFA3Q9BQP9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BPIFA3Q9BQP9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BPIFA3Q9BQP9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BPIFA3Q9BQP9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BPIFA3Q9BQP9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms