Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ALPK3Q96L96 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALPK3Q96L96 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALPK3Q96L96 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALPK3Q96L96 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160 ms