Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYFIP2Q96F07 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYFIP2Q96F07 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CYFIP2Q96F07 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CYFIP2Q96F07 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYFIP2Q96F07 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYFIP2Q96F07 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYFIP2Q96F07 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYFIP2Q96F07 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms