Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CMTM5Q96DZ9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CMTM5Q96DZ9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CMTM5Q96DZ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CMTM5Q96DZ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CMTM5Q96DZ9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CMTM5Q96DZ9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CMTM5Q96DZ9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CMTM5Q96DZ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CMTM5Q96DZ9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CMTM5Q96DZ9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CMTM5Q96DZ9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CMTM5Q96DZ9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CMTM5Q96DZ9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CMTM5Q96DZ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CMTM5Q96DZ9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CMTM5Q96DZ9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CMTM5Q96DZ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CMTM5Q96DZ9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CMTM5Q96DZ9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CMTM5Q96DZ9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CMTM5Q96DZ9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms