Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN3Q969G5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN3Q969G5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAVIN3Q969G5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms