Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF4BQ92750 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF4BQ92750 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF4BQ92750 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF4BQ92750 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF4BQ92750 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF4BQ92750 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF4BQ92750 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF4BQ92750 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF4BQ92750 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF4BQ92750 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF4BQ92750 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF4BQ92750 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF4BQ92750 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF4BQ92750 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF4BQ92750 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF4BQ92750 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF4BQ92750 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF4BQ92750 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TAF4BQ92750 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms