Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPDL3BQ92485 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPDL3BQ92485 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMPDL3BQ92485 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms