Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE85

GRHL3, Grainyhead-like protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL3Q8TE85 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRHL3Q8TE85 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRHL3Q8TE85 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRHL3Q8TE85 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms