Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG16L2Q8NAA4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG16L2Q8NAA4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms