Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGI4Q8N135 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGI4Q8N135 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms