Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
PBRM1Q86U86 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
PBRM1Q86U86 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
PBRM1Q86U86 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
PBRM1Q86U86 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
PBRM1Q86U86 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC41.93■■■■■ 4.3
PBRM1Q86U86 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
PBRM1Q86U86 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
PBRM1Q86U86 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
PBRM1Q86U86 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
PBRM1Q86U86 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
PBRM1Q86U86 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
PBRM1Q86U86 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
PBRM1Q86U86 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
PBRM1Q86U86 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
PBRM1Q86U86 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
PBRM1Q86U86 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC41.89■■■■■ 4.3
PBRM1Q86U86 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.3
PBRM1Q86U86 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
PBRM1Q86U86 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
PBRM1Q86U86 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
PBRM1Q86U86 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
PBRM1Q86U86 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
PBRM1Q86U86 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
PBRM1Q86U86 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
PBRM1Q86U86 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
PBRM1Q86U86 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
PBRM1Q86U86 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
PBRM1Q86U86 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
PBRM1Q86U86 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
PBRM1Q86U86 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
PBRM1Q86U86 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
PBRM1Q86U86 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
PBRM1Q86U86 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
PBRM1Q86U86 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
PBRM1Q86U86 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
PBRM1Q86U86 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
PBRM1Q86U86 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
PBRM1Q86U86 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
PBRM1Q86U86 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
PBRM1Q86U86 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
PBRM1Q86U86 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
PBRM1Q86U86 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
PBRM1Q86U86 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
PBRM1Q86U86 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
PBRM1Q86U86 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
PBRM1Q86U86 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
PBRM1Q86U86 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
PBRM1Q86U86 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
PBRM1Q86U86 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
PBRM1Q86U86 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC41.73■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.27
PBRM1Q86U86 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
PBRM1Q86U86 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
PBRM1Q86U86 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
PBRM1Q86U86 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
PBRM1Q86U86 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
PBRM1Q86U86 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
PBRM1Q86U86 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
PBRM1Q86U86 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
PBRM1Q86U86 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
PBRM1Q86U86 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
PBRM1Q86U86 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
PBRM1Q86U86 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
PBRM1Q86U86 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
PBRM1Q86U86 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
PBRM1Q86U86 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
PBRM1Q86U86 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
PBRM1Q86U86 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
PBRM1Q86U86 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
PBRM1Q86U86 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
PBRM1Q86U86 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms