Protein–RNA interactions for Protein: Q7L985

LINGO2, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO2Q7L985 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINGO2Q7L985 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINGO2Q7L985 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINGO2Q7L985 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINGO2Q7L985 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO2Q7L985 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO2Q7L985 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO2Q7L985 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms