Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATL3Q6DD88 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATL3Q6DD88 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATL3Q6DD88 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATL3Q6DD88 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATL3Q6DD88 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATL3Q6DD88 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATL3Q6DD88 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATL3Q6DD88 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATL3Q6DD88 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATL3Q6DD88 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATL3Q6DD88 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATL3Q6DD88 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATL3Q6DD88 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATL3Q6DD88 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATL3Q6DD88 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATL3Q6DD88 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATL3Q6DD88 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATL3Q6DD88 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATL3Q6DD88 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATL3Q6DD88 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATL3Q6DD88 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATL3Q6DD88 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATL3Q6DD88 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATL3Q6DD88 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATL3Q6DD88 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms