Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
ATL3Q6DD88 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ATL3Q6DD88 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
ATL3Q6DD88 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ATL3Q6DD88 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
ATL3Q6DD88 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ATL3Q6DD88 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ATL3Q6DD88 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ATL3Q6DD88 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ATL3Q6DD88 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ATL3Q6DD88 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
ATL3Q6DD88 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ATL3Q6DD88 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ATL3Q6DD88 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ATL3Q6DD88 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ATL3Q6DD88 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ATL3Q6DD88 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ATL3Q6DD88 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ATL3Q6DD88 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATL3Q6DD88 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ATL3Q6DD88 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ATL3Q6DD88 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ATL3Q6DD88 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ATL3Q6DD88 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ATL3Q6DD88 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATL3Q6DD88 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ATL3Q6DD88 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ATL3Q6DD88 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATL3Q6DD88 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATL3Q6DD88 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATL3Q6DD88 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ATL3Q6DD88 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ATL3Q6DD88 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ATL3Q6DD88 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.22
ATL3Q6DD88 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ATL3Q6DD88 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ATL3Q6DD88 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ATL3Q6DD88 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
ATL3Q6DD88 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATL3Q6DD88 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATL3Q6DD88 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ATL3Q6DD88 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ATL3Q6DD88 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ATL3Q6DD88 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATL3Q6DD88 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ATL3Q6DD88 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ATL3Q6DD88 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATL3Q6DD88 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ATL3Q6DD88 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATL3Q6DD88 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ATL3Q6DD88 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATL3Q6DD88 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATL3Q6DD88 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ATL3Q6DD88 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATL3Q6DD88 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATL3Q6DD88 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATL3Q6DD88 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATL3Q6DD88 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATL3Q6DD88 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATL3Q6DD88 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ATL3Q6DD88 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATL3Q6DD88 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATL3Q6DD88 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATL3Q6DD88 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ATL3Q6DD88 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ATL3Q6DD88 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATL3Q6DD88 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ATL3Q6DD88 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ATL3Q6DD88 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATL3Q6DD88 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ATL3Q6DD88 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATL3Q6DD88 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATL3Q6DD88 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATL3Q6DD88 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATL3Q6DD88 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATL3Q6DD88 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ATL3Q6DD88 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ATL3Q6DD88 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATL3Q6DD88 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATL3Q6DD88 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATL3Q6DD88 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATL3Q6DD88 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATL3Q6DD88 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATL3Q6DD88 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATL3Q6DD88 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ATL3Q6DD88 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ATL3Q6DD88 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATL3Q6DD88 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ATL3Q6DD88 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATL3Q6DD88 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATL3Q6DD88 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATL3Q6DD88 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATL3Q6DD88 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATL3Q6DD88 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATL3Q6DD88 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATL3Q6DD88 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATL3Q6DD88 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATL3Q6DD88 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
ATL3Q6DD88 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATL3Q6DD88 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms